宮內重要的壁畫有：白宮門廳東北壁繪文成公主進藏圖和唐皇五試婚使圖。東大殿天窗東、北、西壁日喀則畫師曲西嘉措繪宗喀巴師徒及印度佛教大師像。白宮頂部東日光殿西壁南側的五台山圖和東壁十三世達賴像和金剛座寶塔。西日光殿福地妙旋宮生活氣息濃郁的釋迦牟尼本生故事。紅宮西大殿東壁繪五世達賴於1652年赴京覲見順治皇帝的情形。第二層迴廊壁畫因著名畫家繪製而知名，如西壁北側大畫師丹增羅布繪五世達賴像，南側畫師索朗傑布繪第斯桑傑嘉措和達剌汗像。二層迴廊東壁至南壁還描繪了宮殿初建到紅宮落成慶典以及舉行法會的整個過程。十三世達賴喇嘛靈塔殿的迴廊，上層繪有他於1908年坐床、赴京覲見光緒皇帝和慈禧太后，以及流亡印度等重大歷史事件。地母堡則描繪了西藏民間信仰的十二丹瑪女神。